К концу века остров, превращённый в запечатанную тюрьму для титанов, стал мрачным памятником человеческой победы: все гигантские земные монстры, включая самого Годзиллу, были пойманы и сосредоточены на небольшом японском архипелаге для исследований. Научные станции и охранные заграждения должны были держать чудовищ под контролем, но внезапное вмешательство нарушило осторожно выстроенную систему. Космические захватчики, тонко вмешавшиеся в чужую экосистему, нашли способ подчинить монстров себе, снять с них оковы и снова обратить силу титанов против людей. Раны на земле, оставленные предыдущими сражениями, мигом наполнились новым ужасом: гиганты, лишённые собственной воли, как орудия разрушения ринулись на континенты.
В ответ мировые силы собрали специализированную команду астронавтов, которой поручили невыполнимую на первый взгляд задачу — в кратчайшие сроки обнаружить и уничтожить таинственную базу пришельцев, управлявшую существами. Отчётливо тикающее время превращало операцию в гонку с гибелью: пока армия титанов подчинялась чужому разуму, города одно за другим могли быть стёрты с лица планеты. Экипаж, отброшенный от привычных космических задач, теперь нёс бремя спасения земной цивилизации, ступая по следам разрушений и подсказок, оставленных на острове и за его пределами. Надежда на успех держалась на тонкой нити — если база не будет ликвидирована немедленно, все усилия человечества по сдерживанию чудовищ окажутся тщетны, и мир станет ареной безумной битвы гигантов.
Учёные, которые когда-то верили в контроль и безопасность, теперь оказывались бессильными свидетелями трансформации своих опытов в орудие уничтожения. Военные посты вокруг острова были перегружены, а спутниковые системы фиксировали странные сигналы, указывающие на централизованный источник управления. Экипажу пришлось покинуть привычные мишени — теперь их полёт носил характер спасательной экспедиции, где каждый неверный шаг мог обрушить расправу титанов на миллионы людей.